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Cis-Element
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Als cis-Element oder cis-wirkendes Element (von lat. cis βdiesseitsβ) wird in der Biologie ein bestimmter Abschnitt in der Erbinformation bezeichnet, der fΓΌr die Regulation eines Gens eine Rolle spielt, das auf demselben DNA-MolekΓΌl liegt wie dieser (molekular betrachtet diesseits). Dieser regulatorische Sequenzabschnitt muss weder RNA noch Protein kodieren und kann in Leserichtung vor oder nach der codierenden Sequenz des zugehΓΆrigen Gens liegen, oder auch innerhalb (auch in einem Intron).
Cis-Elemente stromaufwΓ€rts vor einem Gen stellen oft Bindungsmotive dar fΓΌr (besondere) Transkriptionsfaktoren, die hier als trans-wirkende Faktoren (von lat. trans βjenseitsβ) molekular gesehen von anderer Seite her in die Regulierung der Transkription dieses Gens eingreifen. FΓΌhren cis-Elemente darΓΌber zu einer Hemmung der Transkription, werden sie als Silencer bezeichnet. Cis-Elemente, die zu einer VerstΓ€rkung der Transkription fΓΌhren und nicht Bestandteil von Promotoren sind, werden Enhancer genannt. Ein Beispiel hierfΓΌr ist die DNAse-hypersensitive Stelle des Lysozymgens, die (6.1 kb) vor dem Transkriptionsstart liegt und durch Interaktion mit Transkriptionsfaktoren die Genexpression verstΓ€rkt.cite-ref-pmid1569954-1-0[1] Die Gesamtheit der cis-/trans-AktivitΓ€ten in einem Genlocus bestimmt die IntensitΓ€t, mit der die RNA-Polymerase die Transkription durchfΓΌhrt.
Von cis-Elementen spricht man ebenso bei biologischen Prozessen wie der Rekombination. Beispielsweise sind im tumorinduzierenden Ti-Plasmid von Agrobakterien cis-Elemente in Form repetitiver Sequenzen (Wiederholungsmotiv von 25 Basen) zu finden, welche in dem ringfΓΆrmigen Plasmid als linke bzw. rechte Grenze (left border [lb] bzw. right border [rb]) die t-DNA flankieren.cite-ref-2[2] Diese werden als essentielle cis-Elemente fΓΌr die Γbertragung der t-DNA beim Transfer in die Pflanzenzelle angesehen.cite-ref-3[3]
Contents
β’ Einzelnachweise
β’ Literatur
ββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββββ
Einzelnachweise
cite-note-pmid1569954-11. β T. Grewal, M. Theisen, U. Borgmeyer, T. Grussenmeyer, R. A. Rupp, A. Stief, F. Qian, A. Hecht, A. E. Sippel: The -6.1-kilobase chicken lysozyme enhancer is a multifactorial complex containing several cell-type-specific elements. In: Molecular and cellular biology. Band 12, Nummer 5, Mai 1992, S. 2339β2350. PMID 1569954, PMC 364406 (freier Volltext).
cite-note-22. β N. S. Yadav, J. Vanderleyden u. a.: Short direct repeats flank the t-DNA on a nopaline ti-plasmid. In: Proceedings of the National Academy of Sciences-Biological Sciences. Band 79, Nr. 20, 1982, S. 6322β6326. PMID 16593241, PMC 347113 (freier Volltext).
cite-note-33. β T. Komori, T. Imayama u. a.: Current status of binary vectors and superbinary vectors. In: Plant Physiology. Band 145, Nr. 4, 2007, S. 1155β1160. Current status of binary vectors and superbinary vectors. PMID 18056865, PMC 2151727 (freier Volltext).
Literatur
β’ Peter Schopfer, Axel Brennecke: Pflanzenphysiologie. 6. Auflage. Elsevier Spektrum Akademischer Verlag, MΓΌnchen u. a. 2005, ISBN 3-8274-1561-6.